Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBX1P62877 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBX1P62877 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBX1P62877 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RBX1P62877 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBX1P62877 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBX1P62877 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBX1P62877 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBX1P62877 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBX1P62877 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBX1P62877 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBX1P62877 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBX1P62877 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBX1P62877 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RBX1P62877 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RBX1P62877 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBX1P62877 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBX1P62877 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBX1P62877 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBX1P62877 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBX1P62877 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBX1P62877 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBX1P62877 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBX1P62877 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBX1P62877 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBX1P62877 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBX1P62877 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBX1P62877 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBX1P62877 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBX1P62877 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBX1P62877 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBX1P62877 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBX1P62877 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBX1P62877 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBX1P62877 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBX1P62877 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBX1P62877 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBX1P62877 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBX1P62877 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBX1P62877 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBX1P62877 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBX1P62877 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBX1P62877 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBX1P62877 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBX1P62877 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RBX1P62877 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBX1P62877 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBX1P62877 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBX1P62877 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBX1P62877 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBX1P62877 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBX1P62877 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBX1P62877 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBX1P62877 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBX1P62877 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBX1P62877 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBX1P62877 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBX1P62877 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBX1P62877 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBX1P62877 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBX1P62877 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBX1P62877 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBX1P62877 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBX1P62877 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBX1P62877 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBX1P62877 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBX1P62877 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBX1P62877 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBX1P62877 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBX1P62877 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBX1P62877 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBX1P62877 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBX1P62877 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBX1P62877 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBX1P62877 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBX1P62877 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBX1P62877 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBX1P62877 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBX1P62877 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBX1P62877 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBX1P62877 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBX1P62877 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBX1P62877 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBX1P62877 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBX1P62877 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBX1P62877 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBX1P62877 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RBX1P62877 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBX1P62877 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBX1P62877 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBX1P62877 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBX1P62877 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBX1P62877 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBX1P62877 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBX1P62877 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBX1P62877 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBX1P62877 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBX1P62877 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBX1P62877 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RBX1P62877 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms