Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMC1P62191 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms