Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00310P59036 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00310P59036 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms