Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATN1P54259 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATN1P54259 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATN1P54259 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATN1P54259 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATN1P54259 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATN1P54259 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATN1P54259 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATN1P54259 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATN1P54259 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATN1P54259 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATN1P54259 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATN1P54259 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATN1P54259 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATN1P54259 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATN1P54259 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATN1P54259 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATN1P54259 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATN1P54259 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATN1P54259 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATN1P54259 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATN1P54259 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATN1P54259 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATN1P54259 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATN1P54259 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATN1P54259 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATN1P54259 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATN1P54259 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATN1P54259 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATN1P54259 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATN1P54259 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATN1P54259 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATN1P54259 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATN1P54259 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATN1P54259 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATN1P54259 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATN1P54259 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATN1P54259 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATN1P54259 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATN1P54259 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATN1P54259 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATN1P54259 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATN1P54259 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATN1P54259 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATN1P54259 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATN1P54259 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATN1P54259 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATN1P54259 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATN1P54259 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATN1P54259 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATN1P54259 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATN1P54259 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATN1P54259 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATN1P54259 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATN1P54259 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATN1P54259 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATN1P54259 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATN1P54259 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATN1P54259 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATN1P54259 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATN1P54259 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATN1P54259 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATN1P54259 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATN1P54259 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATN1P54259 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATN1P54259 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATN1P54259 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATN1P54259 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATN1P54259 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATN1P54259 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATN1P54259 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATN1P54259 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATN1P54259 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATN1P54259 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATN1P54259 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATN1P54259 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATN1P54259 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATN1P54259 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATN1P54259 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATN1P54259 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATN1P54259 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATN1P54259 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATN1P54259 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATN1P54259 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATN1P54259 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATN1P54259 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATN1P54259 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATN1P54259 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATN1P54259 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATN1P54259 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATN1P54259 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATN1P54259 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATN1P54259 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATN1P54259 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATN1P54259 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATN1P54259 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATN1P54259 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATN1P54259 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATN1P54259 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATN1P54259 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms