Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK3P51956 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK3P51956 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK3P51956 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK3P51956 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK3P51956 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK3P51956 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK3P51956 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK3P51956 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK3P51956 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK3P51956 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK3P51956 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK3P51956 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK3P51956 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK3P51956 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK3P51956 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK3P51956 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK3P51956 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK3P51956 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK3P51956 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK3P51956 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK3P51956 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK3P51956 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK3P51956 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK3P51956 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK3P51956 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK3P51956 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK3P51956 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK3P51956 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK3P51956 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK3P51956 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK3P51956 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK3P51956 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK3P51956 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK3P51956 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK3P51956 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK3P51956 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK3P51956 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK3P51956 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK3P51956 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK3P51956 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK3P51956 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK3P51956 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK3P51956 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK3P51956 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK3P51956 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK3P51956 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK3P51956 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK3P51956 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK3P51956 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK3P51956 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK3P51956 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK3P51956 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK3P51956 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK3P51956 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK3P51956 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK3P51956 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK3P51956 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK3P51956 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK3P51956 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK3P51956 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEK3P51956 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEK3P51956 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEK3P51956 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEK3P51956 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEK3P51956 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEK3P51956 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK3P51956 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK3P51956 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK3P51956 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK3P51956 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK3P51956 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK3P51956 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK3P51956 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK3P51956 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK3P51956 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK3P51956 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK3P51956 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK3P51956 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK3P51956 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK3P51956 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK3P51956 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK3P51956 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK3P51956 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK3P51956 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK3P51956 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK3P51956 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK3P51956 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK3P51956 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK3P51956 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK3P51956 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK3P51956 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK3P51956 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK3P51956 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK3P51956 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK3P51956 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK3P51956 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK3P51956 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK3P51956 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK3P51956 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms