Protein–RNA interactions for Protein: P51688

SGSH, N-sulphoglucosamine sulphohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSHP51688 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSHP51688 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSHP51688 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSHP51688 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSHP51688 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSHP51688 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSHP51688 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSHP51688 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSHP51688 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSHP51688 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSHP51688 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSHP51688 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSHP51688 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSHP51688 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSHP51688 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSHP51688 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSHP51688 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSHP51688 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSHP51688 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSHP51688 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSHP51688 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSHP51688 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSHP51688 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSHP51688 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSHP51688 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSHP51688 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSHP51688 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSHP51688 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSHP51688 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSHP51688 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSHP51688 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSHP51688 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSHP51688 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSHP51688 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSHP51688 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSHP51688 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSHP51688 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSHP51688 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSHP51688 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSHP51688 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSHP51688 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSHP51688 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSHP51688 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSHP51688 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSHP51688 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSHP51688 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSHP51688 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSHP51688 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSHP51688 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSHP51688 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSHP51688 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSHP51688 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSHP51688 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSHP51688 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSHP51688 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSHP51688 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSHP51688 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSHP51688 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSHP51688 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGSHP51688 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGSHP51688 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGSHP51688 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGSHP51688 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSHP51688 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSHP51688 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSHP51688 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSHP51688 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSHP51688 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSHP51688 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSHP51688 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSHP51688 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSHP51688 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSHP51688 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSHP51688 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSHP51688 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSHP51688 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSHP51688 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSHP51688 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSHP51688 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSHP51688 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSHP51688 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSHP51688 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSHP51688 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSHP51688 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSHP51688 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSHP51688 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSHP51688 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSHP51688 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSHP51688 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSHP51688 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSHP51688 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSHP51688 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSHP51688 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSHP51688 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSHP51688 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSHP51688 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSHP51688 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSHP51688 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSHP51688 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSHP51688 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms