Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC3P51654 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC3P51654 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC3P51654 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC3P51654 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC3P51654 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC3P51654 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC3P51654 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC3P51654 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC3P51654 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC3P51654 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC3P51654 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC3P51654 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC3P51654 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC3P51654 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC3P51654 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC3P51654 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC3P51654 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC3P51654 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC3P51654 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC3P51654 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC3P51654 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC3P51654 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC3P51654 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC3P51654 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC3P51654 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC3P51654 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC3P51654 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC3P51654 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC3P51654 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC3P51654 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC3P51654 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC3P51654 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC3P51654 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPC3P51654 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC3P51654 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC3P51654 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC3P51654 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC3P51654 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC3P51654 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC3P51654 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC3P51654 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC3P51654 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC3P51654 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC3P51654 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC3P51654 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC3P51654 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC3P51654 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC3P51654 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC3P51654 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC3P51654 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC3P51654 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC3P51654 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC3P51654 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC3P51654 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC3P51654 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC3P51654 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC3P51654 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC3P51654 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC3P51654 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC3P51654 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC3P51654 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC3P51654 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC3P51654 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC3P51654 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC3P51654 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC3P51654 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC3P51654 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC3P51654 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC3P51654 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC3P51654 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC3P51654 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC3P51654 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC3P51654 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC3P51654 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC3P51654 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC3P51654 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC3P51654 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC3P51654 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC3P51654 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC3P51654 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC3P51654 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC3P51654 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC3P51654 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC3P51654 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC3P51654 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC3P51654 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC3P51654 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC3P51654 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC3P51654 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC3P51654 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC3P51654 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC3P51654 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC3P51654 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC3P51654 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC3P51654 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC3P51654 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC3P51654 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC3P51654 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC3P51654 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms