Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP4P49662 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP4P49662 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP4P49662 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP4P49662 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP4P49662 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP4P49662 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP4P49662 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP4P49662 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP4P49662 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP4P49662 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP4P49662 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP4P49662 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP4P49662 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP4P49662 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP4P49662 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP4P49662 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP4P49662 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP4P49662 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP4P49662 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP4P49662 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP4P49662 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP4P49662 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP4P49662 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP4P49662 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP4P49662 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP4P49662 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP4P49662 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP4P49662 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP4P49662 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP4P49662 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP4P49662 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP4P49662 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP4P49662 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP4P49662 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP4P49662 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP4P49662 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP4P49662 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP4P49662 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP4P49662 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP4P49662 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP4P49662 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP4P49662 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP4P49662 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP4P49662 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP4P49662 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP4P49662 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP4P49662 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP4P49662 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP4P49662 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP4P49662 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP4P49662 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP4P49662 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP4P49662 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP4P49662 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP4P49662 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP4P49662 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASP4P49662 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP4P49662 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP4P49662 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP4P49662 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP4P49662 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP4P49662 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP4P49662 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP4P49662 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP4P49662 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP4P49662 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP4P49662 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP4P49662 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP4P49662 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP4P49662 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP4P49662 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP4P49662 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP4P49662 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP4P49662 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP4P49662 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP4P49662 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP4P49662 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP4P49662 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP4P49662 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP4P49662 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP4P49662 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP4P49662 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP4P49662 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP4P49662 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP4P49662 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP4P49662 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP4P49662 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP4P49662 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP4P49662 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP4P49662 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP4P49662 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP4P49662 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP4P49662 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP4P49662 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP4P49662 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP4P49662 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP4P49662 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP4P49662 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP4P49662 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms