Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms