Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP3P42574 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP3P42574 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP3P42574 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP3P42574 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP3P42574 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP3P42574 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP3P42574 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP3P42574 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP3P42574 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP3P42574 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP3P42574 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP3P42574 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP3P42574 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP3P42574 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP3P42574 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP3P42574 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP3P42574 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP3P42574 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP3P42574 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP3P42574 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP3P42574 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP3P42574 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP3P42574 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP3P42574 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP3P42574 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP3P42574 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP3P42574 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP3P42574 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP3P42574 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP3P42574 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP3P42574 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP3P42574 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP3P42574 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP3P42574 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP3P42574 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP3P42574 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CASP3P42574 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CASP3P42574 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CASP3P42574 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP3P42574 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP3P42574 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP3P42574 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP3P42574 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP3P42574 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP3P42574 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP3P42574 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP3P42574 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP3P42574 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP3P42574 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP3P42574 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP3P42574 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP3P42574 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP3P42574 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP3P42574 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP3P42574 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP3P42574 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP3P42574 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP3P42574 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP3P42574 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP3P42574 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP3P42574 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP3P42574 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP3P42574 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP3P42574 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP3P42574 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP3P42574 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP3P42574 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP3P42574 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP3P42574 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP3P42574 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP3P42574 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP3P42574 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP3P42574 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP3P42574 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP3P42574 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP3P42574 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP3P42574 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP3P42574 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP3P42574 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP3P42574 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP3P42574 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP3P42574 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP3P42574 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP3P42574 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP3P42574 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP3P42574 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP3P42574 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP3P42574 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP3P42574 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP3P42574 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP3P42574 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP3P42574 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP3P42574 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP3P42574 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP3P42574 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP3P42574 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP3P42574 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP3P42574 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP3P42574 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms