Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 ALR2YFL050C 2577 nt3.75□□□□□ -1.81
DDI1P40087 GPB1YOR371C 2694 nt3.75□□□□□ -1.81
DDI1P40087 PTC1YDL006W 846 nt3.75□□□□□ -1.81
DDI1P40087 SPC19YDR201W 498 nt3.75□□□□□ -1.81
DDI1P40087 PIC2YER053C 903 nt3.75□□□□□ -1.81
DDI1P40087 ERV14YGL054C 417 nt3.75□□□□□ -1.81
DDI1P40087 YGL088WYGL088W 366 nt3.75□□□□□ -1.81
DDI1P40087 COX4YGL187C 468 nt3.75□□□□□ -1.81
DDI1P40087 YLL017WYLL017W 312 nt3.75□□□□□ -1.81
DDI1P40087 IBD2YNL164C 1056 nt3.75□□□□□ -1.81
DDI1P40087 YAR1YPL239W 603 nt3.75□□□□□ -1.81
DDI1P40087 ANT1YPR128C 987 nt3.75□□□□□ -1.81
DDI1P40087 TRM13YOL125W 1431 nt3.75□□□□□ -1.81
DDI1P40087 TDA6YPR157W 1404 nt3.75□□□□□ -1.81
DDI1P40087 XRS2YDR369C 2565 nt3.75□□□□□ -1.81
DDI1P40087 HOS2YGL194C 1359 nt3.75□□□□□ -1.81
DDI1P40087 PHM7YOL084W 2976 nt3.75□□□□□ -1.81
DDI1P40087 TRM11YOL124C 1302 nt3.74□□□□□ -1.81
DDI1P40087 MOB2YFL034C-B 864 nt3.74□□□□□ -1.81
DDI1P40087 PTR3YFR029W 2037 nt3.74□□□□□ -1.81
DDI1P40087 YGL108CYGL108C 423 nt3.74□□□□□ -1.81
DDI1P40087 MMM1YLL006W 1281 nt3.74□□□□□ -1.81
DDI1P40087 YML031C-AYML031C-A 336 nt3.74□□□□□ -1.81
DDI1P40087 PCL1YNL289W 840 nt3.74□□□□□ -1.81
DDI1P40087 VPS68YOL129W 555 nt3.74□□□□□ -1.81
DDI1P40087 ZDS1YMR273C 2748 nt3.74□□□□□ -1.81
DDI1P40087 FLO8YER109C 2400 nt3.74□□□□□ -1.81
DDI1P40087 KRE5YOR336W 4098 nt3.74□□□□□ -1.81
DDI1P40087 PFA5YDR459C 1125 nt3.73□□□□□ -1.81
DDI1P40087 SWC7YLR385C 399 nt3.73□□□□□ -1.81
DDI1P40087 MIH1YMR036C 1665 nt3.73□□□□□ -1.81
DDI1P40087 RKM3YBR030W 1659 nt3.73□□□□□ -1.81
DDI1P40087 SSH4YKL124W 1740 nt3.73□□□□□ -1.81
DDI1P40087 ATM1YMR301C 2073 nt3.72□□□□□ -1.81
DDI1P40087 NAM2YLR382C 2685 nt3.72□□□□□ -1.81
DDI1P40087 RAD26YJR035W 3258 nt3.72□□□□□ -1.81
DDI1P40087 RPC53YDL150W 1269 nt3.72□□□□□ -1.81
DDI1P40087 YDR526CYDR526C 471 nt3.72□□□□□ -1.81
DDI1P40087 CAF16YFL028C 870 nt3.72□□□□□ -1.81
DDI1P40087 YGL132WYGL132W 336 nt3.72□□□□□ -1.81
DDI1P40087 YHB1YGR234W 1200 nt3.72□□□□□ -1.81
DDI1P40087 SOP4YJL192C 705 nt3.72□□□□□ -1.81
DDI1P40087 PIR3YKL163W 978 nt3.72□□□□□ -1.81
DDI1P40087 NRK1YNL129W 723 nt3.72□□□□□ -1.81
DDI1P40087 ATG8YBL078C 354 nt3.72□□□□□ -1.81
DDI1P40087 PHO87YCR037C 2772 nt3.72□□□□□ -1.81
DDI1P40087 AVT7YIL088C 1473 nt3.72□□□□□ -1.81
DDI1P40087 CHD1YER164W 4407 nt3.71□□□□□ -1.81
DDI1P40087 FAA1YOR317W 2103 nt3.71□□□□□ -1.81
DDI1P40087 KRI1YNL308C 1776 nt3.71□□□□□ -1.81
DDI1P40087 SPC105YGL093W 2754 nt3.71□□□□□ -1.82
DDI1P40087 SPI1YER150W 447 nt3.71□□□□□ -1.82
DDI1P40087 REC104YHR157W 549 nt3.71□□□□□ -1.82
DDI1P40087 RPP0YLR340W 939 nt3.71□□□□□ -1.82
DDI1P40087 YPT53YNL093W 663 nt3.71□□□□□ -1.82
DDI1P40087 AST1YBL069W 1290 nt3.71□□□□□ -1.82
DDI1P40087 NAM9YNL137C 1461 nt3.71□□□□□ -1.82
DDI1P40087 SWH1YAR042W 3567 nt3.71□□□□□ -1.82
DDI1P40087 PRP11YDL043C 801 nt3.7□□□□□ -1.82
DDI1P40087 YER034WYER034W 558 nt3.7□□□□□ -1.82
DDI1P40087 SPR6YER115C 576 nt3.7□□□□□ -1.82
DDI1P40087 RRP40YOL142W 723 nt3.7□□□□□ -1.82
DDI1P40087 ICY2YPL250C 411 nt3.7□□□□□ -1.82
DDI1P40087 KRE29YER038C 1395 nt3.7□□□□□ -1.82
DDI1P40087 RCM1YNL022C 1473 nt3.7□□□□□ -1.82
DDI1P40087 NPL4YBR170C 1743 nt3.7□□□□□ -1.82
DDI1P40087 SWP82YFL049W 1872 nt3.69□□□□□ -1.82
DDI1P40087 MSN4YKL062W 1893 nt3.69□□□□□ -1.82
DDI1P40087 ALE1YOR175C 1860 nt3.69□□□□□ -1.82
DDI1P40087 ALG9YNL219C 1668 nt3.69□□□□□ -1.82
DDI1P40087 DHR2YKL078W 2208 nt3.69□□□□□ -1.82
DDI1P40087 SPT3YDR392W 1014 nt3.69□□□□□ -1.82
DDI1P40087 SPO73YER046W 432 nt3.69□□□□□ -1.82
DDI1P40087 SLX8YER116C 825 nt3.69□□□□□ -1.82
DDI1P40087 SKG1YKR100C 1068 nt3.69□□□□□ -1.82
DDI1P40087 YLR402WYLR402W 192 nt3.69□□□□□ -1.82
DDI1P40087 YNR061CYNR061C 660 nt3.69□□□□□ -1.82
DDI1P40087 RGS2YOR107W 930 nt3.69□□□□□ -1.82
DDI1P40087 PNG1YPL096W 1092 nt3.69□□□□□ -1.82
DDI1P40087 PUF2YPR042C 3228 nt3.69□□□□□ -1.82
DDI1P40087 YNR065CYNR065C 3351 nt3.69□□□□□ -1.82
DDI1P40087 YLR345WYLR345W 1530 nt3.69□□□□□ -1.82
DDI1P40087 MTC4YBR255W 2085 nt3.69□□□□□ -1.82
DDI1P40087 SPT6YGR116W 4356 nt3.69□□□□□ -1.82
DDI1P40087 APM1YPL259C 1428 nt3.69□□□□□ -1.82
DDI1P40087 MMS2YGL087C 414 nt3.68□□□□□ -1.82
DDI1P40087 DAN1YJR150C 897 nt3.68□□□□□ -1.82
DDI1P40087 JLP1YLL057C 1239 nt3.68□□□□□ -1.82
DDI1P40087 YLR462WYLR462W 609 nt3.68□□□□□ -1.82
DDI1P40087 YGK3YOL128C 1128 nt3.68□□□□□ -1.82
DDI1P40087 UBP10YNL186W 2379 nt3.68□□□□□ -1.82
DDI1P40087 RAD54YGL163C 2697 nt3.67□□□□□ -1.82
DDI1P40087 AIR1YIL079C 1083 nt3.67□□□□□ -1.82
DDI1P40087 CNB1YKL190W 528 nt3.67□□□□□ -1.82
DDI1P40087 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt3.67□□□□□ -1.82
DDI1P40087 OAZ1YPL052W 879 nt3.67□□□□□ -1.82
DDI1P40087 NUP159YIL115C 4383 nt3.67□□□□□ -1.82
DDI1P40087 GAC1YOR178C 2382 nt3.67□□□□□ -1.82
DDI1P40087 GLO3YER122C 1482 nt3.67□□□□□ -1.82
DDI1P40087 RRP1YDR087C 837 nt3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.4 ms