Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LIPAP38571 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LIPAP38571 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LIPAP38571 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LIPAP38571 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LIPAP38571 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LIPAP38571 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LIPAP38571 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LIPAP38571 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LIPAP38571 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LIPAP38571 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LIPAP38571 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LIPAP38571 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LIPAP38571 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LIPAP38571 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LIPAP38571 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LIPAP38571 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LIPAP38571 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LIPAP38571 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LIPAP38571 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LIPAP38571 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LIPAP38571 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LIPAP38571 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LIPAP38571 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LIPAP38571 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LIPAP38571 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LIPAP38571 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIPAP38571 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIPAP38571 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIPAP38571 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIPAP38571 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIPAP38571 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIPAP38571 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIPAP38571 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIPAP38571 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIPAP38571 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIPAP38571 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIPAP38571 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIPAP38571 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIPAP38571 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LIPAP38571 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIPAP38571 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIPAP38571 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIPAP38571 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIPAP38571 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIPAP38571 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LIPAP38571 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
LIPAP38571 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIPAP38571 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LIPAP38571 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIPAP38571 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIPAP38571 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIPAP38571 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIPAP38571 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIPAP38571 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIPAP38571 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LIPAP38571 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
LIPAP38571 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIPAP38571 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIPAP38571 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIPAP38571 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIPAP38571 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIPAP38571 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIPAP38571 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIPAP38571 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIPAP38571 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIPAP38571 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIPAP38571 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIPAP38571 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIPAP38571 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIPAP38571 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIPAP38571 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIPAP38571 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIPAP38571 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIPAP38571 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIPAP38571 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIPAP38571 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIPAP38571 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIPAP38571 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIPAP38571 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIPAP38571 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIPAP38571 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIPAP38571 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIPAP38571 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIPAP38571 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIPAP38571 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIPAP38571 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIPAP38571 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIPAP38571 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIPAP38571 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIPAP38571 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIPAP38571 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIPAP38571 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIPAP38571 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIPAP38571 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIPAP38571 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIPAP38571 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIPAP38571 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIPAP38571 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LIPAP38571 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms