Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms