Protein–RNA interactions for Protein: P30307

CDC25C, M-phase inducer phosphatase 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25CP30307 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC25CP30307 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC25CP30307 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms