Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHC1P29353 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHC1P29353 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHC1P29353 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHC1P29353 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHC1P29353 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHC1P29353 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHC1P29353 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHC1P29353 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHC1P29353 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SHC1P29353 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHC1P29353 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHC1P29353 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHC1P29353 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHC1P29353 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHC1P29353 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHC1P29353 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHC1P29353 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHC1P29353 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHC1P29353 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHC1P29353 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHC1P29353 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHC1P29353 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHC1P29353 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHC1P29353 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHC1P29353 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHC1P29353 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHC1P29353 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHC1P29353 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHC1P29353 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHC1P29353 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SHC1P29353 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SHC1P29353 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHC1P29353 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHC1P29353 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHC1P29353 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHC1P29353 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHC1P29353 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHC1P29353 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHC1P29353 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHC1P29353 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHC1P29353 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHC1P29353 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SHC1P29353 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHC1P29353 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHC1P29353 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHC1P29353 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHC1P29353 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHC1P29353 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHC1P29353 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHC1P29353 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHC1P29353 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHC1P29353 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHC1P29353 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHC1P29353 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHC1P29353 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHC1P29353 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHC1P29353 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHC1P29353 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHC1P29353 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHC1P29353 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHC1P29353 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHC1P29353 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHC1P29353 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHC1P29353 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHC1P29353 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHC1P29353 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHC1P29353 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SHC1P29353 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHC1P29353 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHC1P29353 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHC1P29353 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHC1P29353 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHC1P29353 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHC1P29353 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SHC1P29353 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SHC1P29353 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SHC1P29353 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SHC1P29353 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHC1P29353 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHC1P29353 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SHC1P29353 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHC1P29353 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHC1P29353 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHC1P29353 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHC1P29353 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHC1P29353 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHC1P29353 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHC1P29353 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SHC1P29353 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHC1P29353 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHC1P29353 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHC1P29353 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHC1P29353 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHC1P29353 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHC1P29353 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHC1P29353 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHC1P29353 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHC1P29353 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHC1P29353 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms