Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX2P28328 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX2P28328 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX2P28328 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PEX2P28328 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PEX2P28328 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PEX2P28328 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PEX2P28328 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PEX2P28328 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PEX2P28328 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PEX2P28328 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PEX2P28328 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PEX2P28328 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PEX2P28328 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PEX2P28328 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PEX2P28328 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PEX2P28328 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PEX2P28328 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PEX2P28328 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PEX2P28328 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PEX2P28328 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PEX2P28328 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PEX2P28328 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PEX2P28328 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PEX2P28328 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PEX2P28328 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PEX2P28328 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PEX2P28328 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PEX2P28328 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PEX2P28328 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PEX2P28328 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PEX2P28328 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PEX2P28328 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PEX2P28328 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PEX2P28328 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PEX2P28328 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PEX2P28328 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PEX2P28328 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PEX2P28328 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PEX2P28328 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PEX2P28328 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PEX2P28328 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PEX2P28328 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PEX2P28328 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PEX2P28328 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PEX2P28328 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PEX2P28328 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PEX2P28328 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PEX2P28328 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PEX2P28328 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PEX2P28328 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PEX2P28328 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PEX2P28328 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PEX2P28328 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX2P28328 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX2P28328 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX2P28328 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX2P28328 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX2P28328 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX2P28328 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX2P28328 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX2P28328 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX2P28328 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX2P28328 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX2P28328 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX2P28328 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX2P28328 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX2P28328 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX2P28328 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX2P28328 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX2P28328 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX2P28328 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX2P28328 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX2P28328 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX2P28328 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX2P28328 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX2P28328 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX2P28328 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX2P28328 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX2P28328 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX2P28328 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PEX2P28328 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PEX2P28328 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PEX2P28328 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PEX2P28328 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PEX2P28328 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PEX2P28328 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PEX2P28328 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PEX2P28328 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PEX2P28328 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PEX2P28328 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PEX2P28328 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PEX2P28328 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PEX2P28328 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PEX2P28328 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PEX2P28328 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PEX2P28328 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PEX2P28328 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PEX2P28328 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PEX2P28328 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms