Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCEA1P23193 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms