Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NTF3P20783 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NTF3P20783 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NTF3P20783 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NTF3P20783 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NTF3P20783 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NTF3P20783 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NTF3P20783 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NTF3P20783 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NTF3P20783 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NTF3P20783 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NTF3P20783 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NTF3P20783 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NTF3P20783 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NTF3P20783 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NTF3P20783 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NTF3P20783 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NTF3P20783 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NTF3P20783 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NTF3P20783 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NTF3P20783 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTF3P20783 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTF3P20783 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTF3P20783 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTF3P20783 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTF3P20783 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTF3P20783 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTF3P20783 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTF3P20783 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTF3P20783 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTF3P20783 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTF3P20783 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTF3P20783 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTF3P20783 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTF3P20783 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTF3P20783 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTF3P20783 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTF3P20783 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTF3P20783 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTF3P20783 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTF3P20783 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTF3P20783 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTF3P20783 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTF3P20783 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTF3P20783 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTF3P20783 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTF3P20783 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTF3P20783 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTF3P20783 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTF3P20783 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NTF3P20783 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTF3P20783 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTF3P20783 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTF3P20783 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NTF3P20783 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTF3P20783 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTF3P20783 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTF3P20783 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTF3P20783 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTF3P20783 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTF3P20783 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTF3P20783 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTF3P20783 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTF3P20783 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTF3P20783 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTF3P20783 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTF3P20783 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTF3P20783 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTF3P20783 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTF3P20783 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NTF3P20783 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTF3P20783 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTF3P20783 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NTF3P20783 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTF3P20783 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTF3P20783 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTF3P20783 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTF3P20783 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTF3P20783 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTF3P20783 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTF3P20783 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTF3P20783 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTF3P20783 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTF3P20783 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTF3P20783 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTF3P20783 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTF3P20783 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTF3P20783 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTF3P20783 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTF3P20783 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTF3P20783 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NTF3P20783 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTF3P20783 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTF3P20783 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTF3P20783 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTF3P20783 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTF3P20783 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTF3P20783 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTF3P20783 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTF3P20783 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms