Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NFKB1P19838 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFKB1P19838 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKB1P19838 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms