Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD53P19397 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD53P19397 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD53P19397 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD53P19397 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD53P19397 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD53P19397 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD53P19397 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD53P19397 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD53P19397 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CD53P19397 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD53P19397 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD53P19397 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CD53P19397 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CD53P19397 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD53P19397 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD53P19397 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD53P19397 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD53P19397 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD53P19397 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD53P19397 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD53P19397 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD53P19397 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD53P19397 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD53P19397 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD53P19397 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD53P19397 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD53P19397 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD53P19397 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD53P19397 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD53P19397 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD53P19397 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD53P19397 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD53P19397 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD53P19397 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD53P19397 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD53P19397 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD53P19397 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CD53P19397 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD53P19397 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD53P19397 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD53P19397 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD53P19397 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CD53P19397 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD53P19397 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD53P19397 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD53P19397 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD53P19397 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD53P19397 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD53P19397 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD53P19397 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD53P19397 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD53P19397 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD53P19397 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD53P19397 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD53P19397 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD53P19397 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD53P19397 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD53P19397 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD53P19397 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD53P19397 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD53P19397 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD53P19397 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD53P19397 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD53P19397 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD53P19397 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD53P19397 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD53P19397 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD53P19397 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD53P19397 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD53P19397 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD53P19397 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD53P19397 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD53P19397 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD53P19397 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD53P19397 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD53P19397 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD53P19397 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD53P19397 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD53P19397 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD53P19397 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD53P19397 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CD53P19397 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD53P19397 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD53P19397 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CD53P19397 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD53P19397 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD53P19397 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD53P19397 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD53P19397 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD53P19397 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD53P19397 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD53P19397 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD53P19397 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD53P19397 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD53P19397 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD53P19397 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD53P19397 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD53P19397 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD53P19397 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms