Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB5P18084 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB5P18084 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms