Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GCFC2P16383 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCFC2P16383 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms