Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRIM27P14373 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms