Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGA4P13612 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA4P13612 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA4P13612 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms