Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XRCC5P13010 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XRCC5P13010 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms