Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MS4A1P11836 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms