Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HKR1P10072 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HKR1P10072 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HKR1P10072 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HKR1P10072 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HKR1P10072 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HKR1P10072 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HKR1P10072 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HKR1P10072 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HKR1P10072 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HKR1P10072 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HKR1P10072 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HKR1P10072 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HKR1P10072 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HKR1P10072 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HKR1P10072 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HKR1P10072 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HKR1P10072 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HKR1P10072 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HKR1P10072 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HKR1P10072 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HKR1P10072 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HKR1P10072 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HKR1P10072 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HKR1P10072 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HKR1P10072 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HKR1P10072 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HKR1P10072 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HKR1P10072 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HKR1P10072 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HKR1P10072 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HKR1P10072 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HKR1P10072 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HKR1P10072 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HKR1P10072 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HKR1P10072 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HKR1P10072 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HKR1P10072 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HKR1P10072 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HKR1P10072 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HKR1P10072 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HKR1P10072 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HKR1P10072 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HKR1P10072 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HKR1P10072 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HKR1P10072 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HKR1P10072 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HKR1P10072 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HKR1P10072 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HKR1P10072 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HKR1P10072 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HKR1P10072 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HKR1P10072 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HKR1P10072 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HKR1P10072 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HKR1P10072 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HKR1P10072 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HKR1P10072 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HKR1P10072 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HKR1P10072 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HKR1P10072 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HKR1P10072 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HKR1P10072 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HKR1P10072 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HKR1P10072 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HKR1P10072 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HKR1P10072 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HKR1P10072 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HKR1P10072 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HKR1P10072 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HKR1P10072 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HKR1P10072 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HKR1P10072 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HKR1P10072 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HKR1P10072 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HKR1P10072 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HKR1P10072 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HKR1P10072 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HKR1P10072 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HKR1P10072 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HKR1P10072 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HKR1P10072 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HKR1P10072 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HKR1P10072 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HKR1P10072 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HKR1P10072 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HKR1P10072 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HKR1P10072 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HKR1P10072 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HKR1P10072 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HKR1P10072 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HKR1P10072 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HKR1P10072 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HKR1P10072 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HKR1P10072 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HKR1P10072 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HKR1P10072 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HKR1P10072 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HKR1P10072 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HKR1P10072 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms