Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM200BP0CF97 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms