Protein–RNA interactions for Protein: P08514

ITGA2B, Integrin alpha-IIb, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2BP08514 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA2BP08514 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA2BP08514 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA2BP08514 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA2BP08514 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA2BP08514 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA2BP08514 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA2BP08514 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA2BP08514 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA2BP08514 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA2BP08514 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA2BP08514 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA2BP08514 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms