Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NEFMP07197 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NEFMP07197 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEFMP07197 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NEFMP07197 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEFMP07197 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEFMP07197 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEFMP07197 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEFMP07197 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEFMP07197 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NEFMP07197 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEFMP07197 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEFMP07197 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NEFMP07197 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NEFMP07197 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEFMP07197 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEFMP07197 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEFMP07197 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEFMP07197 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEFMP07197 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEFMP07197 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEFMP07197 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEFMP07197 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEFMP07197 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEFMP07197 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NEFMP07197 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEFMP07197 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEFMP07197 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEFMP07197 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEFMP07197 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEFMP07197 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEFMP07197 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEFMP07197 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEFMP07197 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEFMP07197 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEFMP07197 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEFMP07197 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEFMP07197 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEFMP07197 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEFMP07197 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEFMP07197 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEFMP07197 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEFMP07197 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEFMP07197 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEFMP07197 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEFMP07197 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEFMP07197 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEFMP07197 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NEFMP07197 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEFMP07197 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEFMP07197 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEFMP07197 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEFMP07197 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NEFMP07197 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEFMP07197 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEFMP07197 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEFMP07197 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEFMP07197 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEFMP07197 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEFMP07197 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEFMP07197 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEFMP07197 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NEFMP07197 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEFMP07197 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEFMP07197 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEFMP07197 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEFMP07197 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEFMP07197 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEFMP07197 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEFMP07197 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEFMP07197 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NEFMP07197 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEFMP07197 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEFMP07197 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEFMP07197 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEFMP07197 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEFMP07197 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEFMP07197 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NEFMP07197 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NEFMP07197 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEFMP07197 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEFMP07197 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEFMP07197 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEFMP07197 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NEFMP07197 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEFMP07197 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEFMP07197 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEFMP07197 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NEFMP07197 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEFMP07197 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEFMP07197 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEFMP07197 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEFMP07197 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEFMP07197 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEFMP07197 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEFMP07197 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEFMP07197 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEFMP07197 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEFMP07197 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEFMP07197 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms