Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HLA-DOAP06340 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HLA-DOAP06340 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HLA-DOAP06340 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HLA-DOAP06340 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HLA-DOAP06340 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HLA-DOAP06340 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HLA-DOAP06340 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HLA-DOAP06340 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HLA-DOAP06340 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HLA-DOAP06340 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HLA-DOAP06340 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HLA-DOAP06340 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HLA-DOAP06340 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HLA-DOAP06340 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HLA-DOAP06340 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HLA-DOAP06340 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HLA-DOAP06340 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HLA-DOAP06340 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HLA-DOAP06340 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HLA-DOAP06340 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HLA-DOAP06340 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HLA-DOAP06340 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HLA-DOAP06340 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HLA-DOAP06340 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HLA-DOAP06340 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms