Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCCAP05165 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCCAP05165 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCCAP05165 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCCAP05165 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCCAP05165 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCCAP05165 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCCAP05165 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCCAP05165 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCCAP05165 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCCAP05165 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCCAP05165 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PCCAP05165 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCCAP05165 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCCAP05165 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCCAP05165 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCCAP05165 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCCAP05165 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCCAP05165 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCCAP05165 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCCAP05165 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCCAP05165 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCCAP05165 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCCAP05165 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCCAP05165 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCCAP05165 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCCAP05165 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCCAP05165 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PCCAP05165 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCCAP05165 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCCAP05165 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCCAP05165 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCCAP05165 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCCAP05165 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCCAP05165 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCCAP05165 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCCAP05165 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCCAP05165 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCCAP05165 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCCAP05165 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PCCAP05165 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCCAP05165 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCCAP05165 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PCCAP05165 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCCAP05165 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCCAP05165 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCCAP05165 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCCAP05165 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCCAP05165 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCCAP05165 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCCAP05165 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCCAP05165 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCCAP05165 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCCAP05165 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCCAP05165 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCCAP05165 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCCAP05165 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCCAP05165 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCCAP05165 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PCCAP05165 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCCAP05165 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCCAP05165 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCCAP05165 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCCAP05165 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PCCAP05165 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCCAP05165 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCCAP05165 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PCCAP05165 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PCCAP05165 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCCAP05165 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCCAP05165 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCCAP05165 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCCAP05165 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCCAP05165 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PCCAP05165 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PCCAP05165 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PCCAP05165 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCCAP05165 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCCAP05165 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCCAP05165 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCCAP05165 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PCCAP05165 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PCCAP05165 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PCCAP05165 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PCCAP05165 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCCAP05165 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PCCAP05165 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PCCAP05165 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PCCAP05165 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PCCAP05165 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PCCAP05165 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCCAP05165 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PCCAP05165 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCCAP05165 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCCAP05165 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PCCAP05165 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCCAP05165 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PCCAP05165 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCCAP05165 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PCCAP05165 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms