Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB4AP04350 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms