Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNAP02545 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNAP02545 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNAP02545 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNAP02545 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNAP02545 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNAP02545 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNAP02545 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNAP02545 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNAP02545 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNAP02545 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNAP02545 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNAP02545 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNAP02545 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNAP02545 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNAP02545 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNAP02545 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNAP02545 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNAP02545 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNAP02545 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNAP02545 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNAP02545 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNAP02545 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNAP02545 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNAP02545 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNAP02545 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNAP02545 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNAP02545 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNAP02545 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNAP02545 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNAP02545 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNAP02545 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNAP02545 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNAP02545 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNAP02545 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNAP02545 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNAP02545 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNAP02545 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNAP02545 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNAP02545 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNAP02545 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNAP02545 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNAP02545 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNAP02545 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNAP02545 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNAP02545 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNAP02545 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNAP02545 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNAP02545 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNAP02545 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNAP02545 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNAP02545 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNAP02545 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNAP02545 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNAP02545 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNAP02545 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNAP02545 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNAP02545 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNAP02545 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNAP02545 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNAP02545 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNAP02545 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNAP02545 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNAP02545 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNAP02545 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNAP02545 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNAP02545 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNAP02545 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNAP02545 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNAP02545 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNAP02545 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNAP02545 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNAP02545 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNAP02545 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNAP02545 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNAP02545 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNAP02545 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNAP02545 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNAP02545 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNAP02545 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNAP02545 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNAP02545 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNAP02545 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNAP02545 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNAP02545 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNAP02545 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNAP02545 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNAP02545 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNAP02545 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNAP02545 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNAP02545 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNAP02545 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNAP02545 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNAP02545 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNAP02545 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNAP02545 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNAP02545 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNAP02545 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNAP02545 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNAP02545 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms