Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX6O95503 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX6O95503 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX6O95503 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX6O95503 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX6O95503 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX6O95503 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX6O95503 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX6O95503 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX6O95503 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX6O95503 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX6O95503 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX6O95503 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX6O95503 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX6O95503 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX6O95503 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX6O95503 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX6O95503 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX6O95503 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX6O95503 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX6O95503 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX6O95503 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX6O95503 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX6O95503 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX6O95503 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX6O95503 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX6O95503 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX6O95503 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX6O95503 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX6O95503 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX6O95503 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX6O95503 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX6O95503 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX6O95503 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX6O95503 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX6O95503 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX6O95503 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX6O95503 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX6O95503 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX6O95503 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX6O95503 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX6O95503 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX6O95503 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX6O95503 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX6O95503 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX6O95503 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX6O95503 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX6O95503 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX6O95503 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX6O95503 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX6O95503 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX6O95503 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX6O95503 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX6O95503 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX6O95503 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX6O95503 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX6O95503 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX6O95503 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX6O95503 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX6O95503 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX6O95503 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX6O95503 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX6O95503 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX6O95503 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX6O95503 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX6O95503 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX6O95503 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX6O95503 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX6O95503 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX6O95503 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX6O95503 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX6O95503 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX6O95503 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX6O95503 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX6O95503 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX6O95503 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX6O95503 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX6O95503 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX6O95503 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX6O95503 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX6O95503 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX6O95503 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX6O95503 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX6O95503 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX6O95503 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX6O95503 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX6O95503 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX6O95503 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX6O95503 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX6O95503 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX6O95503 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX6O95503 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX6O95503 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX6O95503 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX6O95503 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX6O95503 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX6O95503 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX6O95503 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX6O95503 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX6O95503 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms