Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DKK1O94907 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DKK1O94907 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DKK1O94907 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DKK1O94907 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DKK1O94907 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DKK1O94907 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DKK1O94907 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DKK1O94907 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DKK1O94907 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DKK1O94907 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DKK1O94907 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DKK1O94907 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DKK1O94907 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DKK1O94907 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DKK1O94907 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DKK1O94907 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DKK1O94907 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DKK1O94907 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DKK1O94907 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DKK1O94907 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DKK1O94907 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DKK1O94907 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DKK1O94907 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DKK1O94907 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DKK1O94907 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DKK1O94907 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DKK1O94907 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DKK1O94907 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DKK1O94907 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DKK1O94907 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DKK1O94907 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DKK1O94907 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DKK1O94907 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DKK1O94907 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DKK1O94907 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DKK1O94907 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DKK1O94907 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DKK1O94907 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DKK1O94907 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DKK1O94907 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DKK1O94907 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DKK1O94907 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DKK1O94907 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DKK1O94907 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DKK1O94907 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DKK1O94907 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DKK1O94907 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DKK1O94907 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DKK1O94907 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DKK1O94907 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DKK1O94907 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DKK1O94907 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DKK1O94907 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DKK1O94907 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DKK1O94907 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DKK1O94907 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DKK1O94907 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DKK1O94907 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DKK1O94907 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DKK1O94907 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DKK1O94907 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DKK1O94907 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DKK1O94907 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DKK1O94907 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DKK1O94907 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DKK1O94907 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DKK1O94907 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DKK1O94907 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DKK1O94907 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DKK1O94907 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DKK1O94907 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DKK1O94907 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DKK1O94907 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DKK1O94907 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DKK1O94907 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DKK1O94907 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DKK1O94907 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DKK1O94907 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DKK1O94907 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DKK1O94907 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DKK1O94907 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DKK1O94907 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DKK1O94907 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DKK1O94907 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DKK1O94907 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DKK1O94907 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DKK1O94907 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DKK1O94907 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DKK1O94907 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DKK1O94907 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DKK1O94907 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DKK1O94907 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DKK1O94907 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DKK1O94907 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DKK1O94907 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DKK1O94907 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DKK1O94907 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DKK1O94907 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DKK1O94907 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms