Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms