Protein–RNA interactions for Protein: O75531

BANF1, Barrier-to-autointegration factor, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BANF1O75531 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BANF1O75531 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BANF1O75531 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BANF1O75531 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BANF1O75531 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BANF1O75531 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BANF1O75531 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BANF1O75531 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BANF1O75531 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BANF1O75531 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BANF1O75531 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BANF1O75531 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BANF1O75531 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BANF1O75531 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BANF1O75531 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BANF1O75531 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BANF1O75531 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BANF1O75531 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BANF1O75531 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BANF1O75531 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BANF1O75531 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BANF1O75531 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BANF1O75531 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BANF1O75531 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BANF1O75531 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BANF1O75531 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BANF1O75531 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BANF1O75531 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BANF1O75531 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BANF1O75531 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BANF1O75531 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BANF1O75531 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BANF1O75531 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BANF1O75531 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BANF1O75531 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BANF1O75531 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BANF1O75531 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BANF1O75531 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BANF1O75531 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BANF1O75531 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BANF1O75531 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BANF1O75531 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BANF1O75531 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BANF1O75531 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BANF1O75531 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BANF1O75531 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BANF1O75531 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BANF1O75531 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BANF1O75531 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BANF1O75531 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BANF1O75531 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BANF1O75531 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BANF1O75531 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BANF1O75531 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BANF1O75531 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BANF1O75531 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BANF1O75531 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BANF1O75531 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BANF1O75531 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BANF1O75531 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BANF1O75531 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BANF1O75531 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BANF1O75531 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BANF1O75531 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BANF1O75531 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BANF1O75531 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BANF1O75531 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BANF1O75531 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BANF1O75531 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BANF1O75531 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BANF1O75531 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BANF1O75531 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BANF1O75531 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BANF1O75531 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BANF1O75531 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BANF1O75531 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BANF1O75531 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BANF1O75531 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BANF1O75531 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BANF1O75531 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BANF1O75531 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BANF1O75531 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BANF1O75531 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BANF1O75531 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BANF1O75531 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BANF1O75531 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BANF1O75531 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BANF1O75531 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BANF1O75531 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BANF1O75531 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BANF1O75531 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BANF1O75531 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BANF1O75531 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BANF1O75531 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BANF1O75531 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BANF1O75531 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BANF1O75531 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BANF1O75531 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BANF1O75531 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BANF1O75531 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms