Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX2O60749 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX2O60749 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX2O60749 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX2O60749 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX2O60749 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX2O60749 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX2O60749 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX2O60749 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX2O60749 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX2O60749 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX2O60749 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX2O60749 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX2O60749 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX2O60749 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX2O60749 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX2O60749 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX2O60749 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX2O60749 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX2O60749 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX2O60749 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX2O60749 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX2O60749 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX2O60749 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX2O60749 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX2O60749 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX2O60749 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX2O60749 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX2O60749 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNX2O60749 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX2O60749 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX2O60749 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX2O60749 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX2O60749 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX2O60749 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX2O60749 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX2O60749 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX2O60749 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX2O60749 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX2O60749 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX2O60749 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX2O60749 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX2O60749 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX2O60749 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX2O60749 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX2O60749 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX2O60749 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX2O60749 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX2O60749 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX2O60749 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX2O60749 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX2O60749 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX2O60749 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX2O60749 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX2O60749 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX2O60749 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX2O60749 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX2O60749 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX2O60749 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX2O60749 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX2O60749 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX2O60749 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX2O60749 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX2O60749 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX2O60749 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX2O60749 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX2O60749 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX2O60749 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX2O60749 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX2O60749 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX2O60749 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX2O60749 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX2O60749 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX2O60749 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX2O60749 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX2O60749 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX2O60749 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX2O60749 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX2O60749 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX2O60749 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX2O60749 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX2O60749 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX2O60749 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX2O60749 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX2O60749 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX2O60749 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX2O60749 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX2O60749 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX2O60749 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX2O60749 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX2O60749 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX2O60749 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX2O60749 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX2O60749 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX2O60749 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX2O60749 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX2O60749 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX2O60749 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX2O60749 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX2O60749 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms