Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARCH6O60337 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms