Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATCO43716 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATCO43716 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATCO43716 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATCO43716 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATCO43716 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATCO43716 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATCO43716 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATCO43716 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATCO43716 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATCO43716 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GATCO43716 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATCO43716 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATCO43716 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATCO43716 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATCO43716 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATCO43716 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATCO43716 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATCO43716 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATCO43716 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATCO43716 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATCO43716 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATCO43716 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATCO43716 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATCO43716 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATCO43716 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATCO43716 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATCO43716 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATCO43716 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATCO43716 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GATCO43716 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GATCO43716 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GATCO43716 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GATCO43716 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GATCO43716 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GATCO43716 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GATCO43716 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GATCO43716 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GATCO43716 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GATCO43716 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GATCO43716 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GATCO43716 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GATCO43716 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GATCO43716 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GATCO43716 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GATCO43716 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GATCO43716 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATCO43716 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATCO43716 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATCO43716 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATCO43716 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATCO43716 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATCO43716 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATCO43716 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATCO43716 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATCO43716 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATCO43716 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATCO43716 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATCO43716 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATCO43716 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATCO43716 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATCO43716 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATCO43716 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATCO43716 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATCO43716 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATCO43716 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATCO43716 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATCO43716 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATCO43716 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATCO43716 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATCO43716 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATCO43716 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATCO43716 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATCO43716 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATCO43716 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATCO43716 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATCO43716 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GATCO43716 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATCO43716 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATCO43716 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATCO43716 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATCO43716 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GATCO43716 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATCO43716 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATCO43716 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATCO43716 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATCO43716 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATCO43716 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATCO43716 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATCO43716 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATCO43716 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATCO43716 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATCO43716 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GATCO43716 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GATCO43716 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GATCO43716 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GATCO43716 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GATCO43716 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GATCO43716 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GATCO43716 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms