Protein–RNA interactions for Protein: O14717

TRDMT1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1O14717 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRDMT1O14717 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRDMT1O14717 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TRDMT1O14717 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRDMT1O14717 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TRDMT1O14717 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDMT1O14717 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDMT1O14717 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDMT1O14717 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDMT1O14717 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDMT1O14717 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDMT1O14717 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDMT1O14717 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDMT1O14717 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDMT1O14717 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDMT1O14717 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDMT1O14717 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDMT1O14717 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDMT1O14717 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRDMT1O14717 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRDMT1O14717 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRDMT1O14717 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRDMT1O14717 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRDMT1O14717 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms