Protein–RNA interactions for Protein: O00626

CCL22, C-C motif chemokine 22, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL22O00626 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL22O00626 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL22O00626 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL22O00626 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL22O00626 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL22O00626 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL22O00626 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL22O00626 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL22O00626 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL22O00626 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL22O00626 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL22O00626 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL22O00626 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL22O00626 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL22O00626 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL22O00626 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL22O00626 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL22O00626 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL22O00626 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL22O00626 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL22O00626 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL22O00626 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL22O00626 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL22O00626 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL22O00626 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL22O00626 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL22O00626 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL22O00626 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL22O00626 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL22O00626 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL22O00626 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL22O00626 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL22O00626 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL22O00626 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL22O00626 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL22O00626 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL22O00626 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL22O00626 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL22O00626 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL22O00626 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL22O00626 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL22O00626 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL22O00626 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL22O00626 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL22O00626 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL22O00626 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL22O00626 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL22O00626 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL22O00626 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL22O00626 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL22O00626 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL22O00626 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL22O00626 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL22O00626 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL22O00626 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL22O00626 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL22O00626 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL22O00626 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL22O00626 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCL22O00626 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCL22O00626 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCL22O00626 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL22O00626 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL22O00626 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL22O00626 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL22O00626 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL22O00626 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL22O00626 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL22O00626 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL22O00626 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL22O00626 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL22O00626 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL22O00626 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL22O00626 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL22O00626 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL22O00626 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL22O00626 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL22O00626 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL22O00626 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL22O00626 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL22O00626 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL22O00626 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL22O00626 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL22O00626 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL22O00626 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL22O00626 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL22O00626 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL22O00626 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL22O00626 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL22O00626 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL22O00626 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL22O00626 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL22O00626 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL22O00626 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL22O00626 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL22O00626 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL22O00626 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL22O00626 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL22O00626 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL22O00626 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms