Protein–RNA interactions for Protein: O00231

PSMD11, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD11O00231 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD11O00231 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms