Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
B4DEV8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
B4DEV8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
B4DEV8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
B4DEV8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
B4DEV8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
B4DEV8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
B4DEV8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
B4DEV8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
B4DEV8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
B4DEV8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
B4DEV8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
B4DEV8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
B4DEV8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
B4DEV8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
B4DEV8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
B4DEV8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
B4DEV8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
B4DEV8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
B4DEV8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
B4DEV8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
B4DEV8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
B4DEV8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
B4DEV8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
B4DEV8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
B4DEV8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
B4DEV8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
B4DEV8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
B4DEV8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
B4DEV8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
B4DEV8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
B4DEV8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
B4DEV8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
B4DEV8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
B4DEV8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
B4DEV8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
B4DEV8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
B4DEV8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
B4DEV8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
B4DEV8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DEV8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DEV8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DEV8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DEV8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DEV8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DEV8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DEV8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DEV8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DEV8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DEV8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DEV8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DEV8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DEV8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DEV8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DEV8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DEV8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DEV8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DEV8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DEV8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DEV8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DEV8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DEV8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DEV8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DEV8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DEV8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DEV8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DEV8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DEV8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DEV8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DEV8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DEV8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DEV8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DEV8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DEV8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DEV8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DEV8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DEV8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DEV8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DEV8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DEV8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DEV8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DEV8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DEV8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DEV8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DEV8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DEV8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DEV8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DEV8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DEV8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DEV8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DEV8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DEV8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DEV8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DEV8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DEV8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DEV8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DEV8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DEV8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DEV8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DEV8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms