Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNDIG1LA6NDD5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms