Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L4A6NCW7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP17L4A6NCW7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms