Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LAMB4A4D0S4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LAMB4A4D0S4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMB4A4D0S4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms