Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf170A2RU37 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms