Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WVE0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WVE0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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A0A087WVE0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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A0A087WVE0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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A0A087WVE0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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A0A087WVE0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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A0A087WVE0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
A0A087WVE0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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A0A087WVE0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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A0A087WVE0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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A0A087WVE0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
A0A087WVE0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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A0A087WVE0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
A0A087WVE0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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A0A087WVE0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
A0A087WVE0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
A0A087WVE0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
A0A087WVE0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
A0A087WVE0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
A0A087WVE0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
A0A087WVE0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087WVE0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087WVE0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087WVE0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087WVE0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087WVE0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087WVE0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087WVE0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087WVE0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087WVE0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087WVE0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087WVE0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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